ご回答ありがとうございます。
黒の代替色につきましてはご検討下さい。
また、正直黒で文字入れするほうが多いので、「代替色を使用しない」という設定が
できれば尚いいと思っております。
設定が維持されない件につきましては、
上記の手順でリアルタイムチェックを設定したところ解決致しました。
使っているセキュリティはWin7x64にデフォルトで入っていた
Microsoft Security Essentials バージョン: 2.1.1116.0 です。
また、別の現象で上記設定をする前は、黒の代替色が赤だったときに
あああああ
あああああああ
あああ（←ここの文字をカット&ペーストすると）
あああ（←黒になる）
あああああ
あああああああ
という現象も起きていたのですがこれも直りました。
ちなみに両現象とも、縦書き横書きに関わらず発生しておりました。
ありがとうございました。
■[黒色の代替色]について
現状では、[テキストプロパティ]パレット→[黒色の代替色]の色の初期値を設定を維持
することはできません。
こちらは直前に選択された[カラー]パレットの描画色が反映されます。
本件につきましては、今後の開発に活かすべく、対応を検討して参ります。
■[スタイルを使用]のチェックについて
[テキストプロパティ]の[文字の設定]で[スタイルを使用]チェックボックスをオンに
されても横書きで入力を行われた場合は、次に[テキストプロパティ]を開いて文字入力
をされる場合に設定がクリアされてしまい、チェックが外れてしまうとご申告いただき
ましたが、こちらにつきましてはお客様と同じIllustStudioのバージョン、OSにて確認を
行いましたが、現象を確認することができませんでした。
セキュリティソフトのリアルタイムスキャンの影響などにより、IllustStudioが正常に動作
していない可能性が考えられますので、以下のIllustStudioのファイルを、セキュリティの
除外指定にしていただき、再度動作のご確認お願いいたします。
・IllustStudioのアプリケーションが入っているフォルダ
例．C:\Program Files\CELSYS（←このフォルダです）
（※Windows 7 64bit版の場合は「Program Files(x86)」となります。）
・[IllustStudio Ver1 設定]フォルダ
[マイドキュメント]または[ドキュメント]内にある[IllustStudio Ver1 設定]フォルダ（←このフォルダです）
・[Preference]フォルダ
例．C:\Users\（ユーザー名）\AppData\Roaming\CELSYS（←このフォルダです）
※１上記の順番でフォルダを開いていきます。
※２（ユーザー名）とはお客さまがパソコンにログインされるときのアカウントの名前の
フォルダを指します。
※３[AppData]フォルダが表示されない場合は、[コントロールパネル]→[デスクトップ
のカスタマイズ]→[フォルダー オプション]を開き、[表示]タブの[詳細設定]一覧の
[ファイルとフォルダーの表示]→[隠しファイル、隠しフォルダー、および隠しドライブ
を表示する]ラジオボタンを有効にしてから、[適用]ボタンをクリックします。
上記の操作をされましても、当該の現象が発生する場合は、お手数ですが、お使いの
セキュリティソフトの名称、バージョンをこちらまでお知らせください。
よろしくお願いいたします。