恐れ入りますが、添付いただいた画像につきまして、他の方の作品の
転載であると思われたため、削除させていただきました。
※ご自身の作品である場合や、権利者様の許可を得ている場合は
お手数ですがその旨ご記載ください。
ご要望されているように、一部塗り部分を半透明にしたい場合、
かぶせる部分のみレイヤーを分けて不透明度を下げるか、
カラーパレットで色の不透明度を下げる方法、あるいは彩色用ツールの
不透明度を下げて塗る方法などが考えられます。
それぞれの不透明度の設定は、下図の場所で行います。
■レイヤーの不透明度
■色の不透明度
■ツールの不透明度
上記をご確認の上、やりやすい方法をお試しいただければと思います。