IllustStudioは、アンチエイリアスという線を滑らかにするための
ボケ足部分が付いているため、ボケ足の端で塗り止まると少し
隙間が空いているようになる場合があります。
その場合、塗りつぶしツールを選択した状態で、[ツールオプション]パレットの
[領域を拡縮]と[最も濃いピクセルまで拡張]にチェックを入れます。
さらに[領域を拡縮]は10などの大き目の数値にしておきます。
上記設定で塗りつぶすと、塗りつぶし領域を広げつつも線の最も濃い部分で
塗り止まってくれるため、隙間ができずに塗りつぶせます。
塗りつぶしツールの使用方法についてはこちらにも詳細の記載が
ありますので、よろしければご参照ください。