保存時の形式は、どれを選択していますでしょうか。
JPEGやBMPなど、画像形式によっては透明の情報を
持つことができないため、透明部分が白で保存されます。
透明情報を持てる汎用画像形式としては、PNGがございます。
下記の手順で保存し、透明部分が保持されるかどうかご確認ください。
１．レイヤーパレットで[用紙]レイヤーを非表示にします。
２．[ファイル]メニュー→[指定の形式で保存]→[png]を選択します。
３．[別名で保存]ダイアログが出るので、[設定を変更]をクリックします。
４．表現色を[RGBAカラー]にして[OK]を押し、保存します。
お手数ですが、よろしくお願いいたします。