透過状態で、汎用画像などで保存したいということで
よろしいでしょうか。
線画の背景を透過して作成してある場合は、下記手順で
PNG形式で保存することで、透過状態を保てます。
１．用紙レイヤーを非表示にし、透過したい箇所が
ピンクの格子模様になるのを確認します。
２．[ファイル]メニュー→[指定の形式で保存]→[png]を選択します。
３．[設定を変更]をクリックし、PNG設定ダイアログで[表現色]を
[RGBAカラー]にして[OK]を押します。
４．この状態で書き出すと、透過状態で保存できます。
上記をお試しいただき、ご希望の動作になるかご確認ください。