お問い合わせいただき、ありがとうございます。
[ファイルオブジェクトの更新]時に、ご記載いただいたような状態になる
不具合でしたので、こちらは今後の開発にて修正をさせていただきます。
ご不便をおかけし申し訳ございません。
現状の回避策としては、ファイルオブジェクトのクリップを移動し、
クリップ開始位置を開始フレームに合わせてからオブジェクトを
更新するという方法になります。
大変お手数ですが、現状はこちらの手順をご利用ください。
作業手順としては、本来ならご記載いただいた方法で問題ございませんので、
不具合修正までお待ちいただけますようお願いいたします。