この質問欄と類似した現象に悩んでおり、対策をどうすればいいか検索していた際こちらにたどり着きました。
わたしも同じようにベクターレイヤーに描画した線を消しゴムで消すと3〜8秒ほど止まり、反応しません。
消しゴムをかけるたびに止まると作業がとてもストレスフルで積み重なると時間のロスも相当なため、なんとか直したいのですが、手段はありますでしょうか。
他のアプリケーションをすべて終了し、コミスタのみの状態で動かしたり、複数あるベクターレイヤーをすべて統合して一枚にしてみても現象が収まりません。
PC自体を再起動したり、コミスタを再インストールもしてみましたが改善されません。
サポート担当様の投稿内容について自分の環境で書くと以下になります。
・ペンツール・直線ツールでの描画の際には問題ありません。その他のツールでも特に問題ありません。
ただし、取り消し(command+z)をした場合は同様に止まります。
・作品データは外付けHDDではなくPC上に保存しています。
・ラスタライズしたレイヤーでは同様の現象は起こりません。
・Macのスペック
プロセッサ:3.2GHz Intel Core i3
メモリ:12GB 1333MHz DDR3
・コミスタの割り当てサイズ 80%(手動MAXの状態です)
・セキュリティソフト Sophos Anti-Virus 9.0.11
・いま進行中の作品の情報
用紙:B4(8598*6071px)
解像度:600dpi
ページ数:4p
データサイズ:62.9MB(15日15時現在)
最初の投稿者様の投稿から2年経過していますが、どうぞご確認とご返答いただければと思います。
よろしくお願いいたします。

詳細を確認させていただくため、下記の内容を操作、確認いただいて、結果を
お知らせいただけますでしょうか。
・ベクターレイヤーに対して消しゴムを使用した際と記載頂いていますが、
同レイヤーに対してペンツールなどの描画系ツールを使用した場合には、
8秒止まるような現象にはならないという事でしょうか。
また、その他の編集の操作では全く問題ないという事でしょうか。
・該当の作品データは、ご使用のパソコン内に保存されていますでしょうか。
外付けHDD等パソコン外に保存されている場合は、デスクトップへ移動して
いただき、そこから開いた状態で、確認をお願いたします。
・該当のベクターレイヤーを[レイヤー]メニュー→[レイヤーのラスタライズ]を
選択し、[元のレイヤーを残しますか]のメッセージで[OK]ボタンを押して
いただきますと、ベクターレイヤーが非表示となり、その描画内容が別途
ラスターレイヤーとして作成されますので、そのラスターレイヤーに対して
消しゴムを使用された際に現象が発生するかご確認ください。
・[アップル]メニュー→[このMacについて]を選択していただき、表示された
画面にて、[プロセッサ][メモリ]に記載されている内容をお知らせください。
・パソコンを再起動していただき、ComicStudioのみを起動した状態で、現象が
発生するかご確認ください。
・[ComicStudioEX]メニューにて[環境設定]を選択し、表示された画面の左側の
メニューにある[メモリ]を選択して、右側に表示される[割り当てサイズを指定]
で現在の%より、数値を高く設定していただいて、ComicStudioを再起動後、
現象が発生するかご確認ください。
・ペンタブレットをご使用の場合は、メーカー名、型番、ドライババージョン
をお知らせください。
・セキュリティソフトをご使用の場合は、ソフト名、バージョンをお知らせ
ください。
・使用されている用紙サイズ、解像度、ページ数と、その作品フォルダの
データサイズをご確認いただき、お知らせください。
お手数ですが、よろしくお願いいたします。