ComicStudioは、印刷用のモノクロマンガ制作に特化した
ソフトですので、基本的に線はモノクロ2階調で描画されます。
そのため、添付いただいた画像のように、100%表示すると
モニタ上ではジャギーが目立ちます。
原稿の解像度が600dpiなら、印刷すればこのジャギーは
ほとんど目立ちません。
今回縮小して出力するのは、Webなどでの公開を想定している
ためでしょうか。
Web用途の場合は、色深度を[グレースケール]にして書き出しを
することをおすすめいたします。
グレースケールで出力すれば、線画部分の縮小時にアンチエイリアス
(ボケ足)がかかるので、ギザギザしたジャギーが軽減されます。
加えて、[トーン設定]で[すべてグレーで出力]にチェックを入れると、
トーン部分がグレーになるので、モニタ上でもモアレません。
お手数ですが、ご確認のほどよろしくお願いいたします。