お問い合わせいただき、ありがとうございます。
新規作成時に「同人誌入稿」を選んでいる場合、複数ページの作品となりますので、
仰せの通りCLIP STUDIO PAINT PROでは開くことができません。
パソコン側で編集を行いたい場合は、1ページずつ複製を保存していただき、
複製保存した単ページファイルをパソコンへ共有してください。
[iPad]→[パソコン]→[iPad]の一例を、以下に記載いたしますので
ご参考ください。
・ページの複製保存は、複製したいページを開き編集できる状態にして、
[ファイル]→[複製を保存]→[.clip(CLIP STUDIO FORMAT ファイル)]を
選択してください。
・[.clip]ファイルをパソコンへ送ります。
・パソコン側で[.clip]ファイルを開き、編集終了後は[保存]します。
・[.clip]ファイルをiPadへ送ります。
・iPad側のページ管理画面を開き、対象のページを選択→[ページ管理]メニュー
→[ページの置き換え…]→パソコンで編集したページを選択してください。
※clipファイルの共有については以下のページをご参考ください。
■[5]CLIP STUDIOクラウドサービスでデータを共有する
以上よろしくお願いいたします。