1.2へのアップデートで一部のショートカットが機能しなくなった

できませんでした。

恐れ入りますが、以下の方法でショートカットの初期化をしていただき、
再度[Ctrl+数字]キーの組み合わせによるショートカットをお試しください。

■初期化起動の方法
１．IllustStudio 1.0が起動している場合は終了します。
２．[Shift]キーを押しながら、デスクトップ上のIllustStudio 1.0の
ショートカットまたはアプリケーション本体をダブルクリックします。
３．メッセージダイアログ「初期設定をクリアして起動しますか？」が表示
されるので、[はい]ボタンをクリックします。
４．[初期化起動]ダイアログが表示されますので、[ショートカット設定]
チェックボックスを有効にして[OK]ボタンをクリックします。
５．IllustStudio 1.0が起動します。

続きまして、ショートカット設定の[ツール補助操作]ですが、キーを押下する
ことでツールが切り替わる通常のショートカット操作とは異なり、キーを押下
している間のみ操作が有効になる描画補助を主としたショートカット機能に
なります。