sakurapさまこんにちは。朧月夜に舞う胡蝶と申します。
横から失礼します。
ペンツールなどの設定ができないとのことですが、以下のように各項目が折りたたまれていませんか？
この場合、「基本」や「効果」などの左にある「+」をクリックして展開することで
その項目の設定を変更することが可能になります。
（下記の例ではすべての項目を展開したあと、さらにリストの一番下にある
「すべてのパラメータを表示する」を選択してパラメータをすべて表示した状態にしてあります）
あと、各項目で灰色に表示され選択できないものは
それらの項目を総括する最上位の項目の左に存在するチェックボックスにチェックを入れたり
描画スタイルを変更したりすることで選択できるようになるかと思います。
（たとえば上記の例で「入り」や「抜き」を設定したい場合は「入り抜き」の左にある
チェックボックスにチェックを入れます。
また、パターンブラシにのみ存在する「散布」や「密度」を設定したい場合は
描画スタイルを「リボン」などから「スプレー」に変更する必要があります。
（「散布」も「密度」も描画スタイルが「スプレー」のときのみ適用される項目となります。
それ以外の「リボン」や「スタンプ」などでは灰色になり選択・設定できません））
以上、取り留めのないことをだらだらと述べてきましたが、少しでも参考になりましたら幸いです。
それと乱文失礼いたしました。
[パレット]メニューの下記項目にチェックが入っている事を確認して下さい。
(チェックが入っていない場合は、その項目を選択してチェックが入っている事を
確認して下さい。)
＊ツールオプションの分離
＊ツール
＊ツールセット
＊ツールオプション
＊レイヤー
＊カラー
上記パレットを表示していただきますと、ペン、ブラシツールや合成モードなど
設定を行うことが出来ます。
各ツールのカスタマイズ方法等、下記ページにてまとめておりますので
ご参照頂けますようお願いいたします。
■IllustStudio 機能解説！トラの巻き 一覧
すでに上記パレットなどをご確認済みで、数値などが変更できない、という場合は
お手数ですが、再度ご返信頂けますようお願いいたします。
また以下の情報もあわせてお知らせ頂けますようお願いいたします。
ご使用のOS：
ご使用のIllustStudioの種類：IllustStudio( )、IllustStudioMini( )
ご使用のタブレットメーカー、型番：
タブレットドライバのバージョン：
ご使用のセキュリティソフト名とバージョン：