レイヤーが上手く起動しません

以下の手順をお試しください。

[パレット]メニューの[ツールオプション]と[ツールオプションの
分離]を有効にし、左上のメニュー表示から[初期設定に
戻す]を選択し改善するかご確認ください。



改善しない場合は、塗りつぶしツールオプションの
[すべてのパラメータを表示する]をクリックし全ての
設定が表示できる状態のスクリーンショットを添付してください。



なお、以下の点もお知らせください。

　・[ヘルプ]メニューの[バージョン情報]を選択し、ご使用の
　　製品バージョンをお知らせください。

　・ご使用のOSをお知らせください。

　・塗りつぶしツールを選択し、キャンバスにカーソルを
　　持っていくと、カーソルはどのような表示になるか
　　お知らせください。

■スクリーンショットの取得手順
１．キーボードの[PrintScreen]または[Prt Sc]とキートップに表示されて
　　いるキーを押します。

２．[Windows スタート]メニューをクリックし、[すべてのプログラム]の
　　[アクセサリ]から[ペイント]を選択します。

３．[ペイント]というアプリケーションが起動します。

４．[編集]メニューから[貼り付け]を選択します。

５．[PrintScreen]キーを押したときの画面のイメージが貼り付けられます。

６．[ファイル]メニューから[上書き保存]を選択し、デスクトップなど適当な
　　場所にファイルを保存します。ファイル形式はJPEGなどを選択してください。

お手数ですが、よろしくお願いします。

くろ蜜さまこんばんは。朧月夜に舞う胡蝶と申します。
横から失礼します。

＞レイヤー１に主線を描いてそれで次のレイヤーに色分けをしたのですが主線関係なしに

＞画面全部塗れるんです。

とのことですが、それだけではどういう状況なのかが分からないため
正確なアドバイスは行えませんが、以下のように線画レイヤを参照レイヤに設定したあとで
「塗りつぶし（主線を参照）」などを使用して塗りつぶしを行うことで
必要な部分にだけ塗りつぶしを行うことが出来るかと思います。

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1.まずイラスタを立ち上げ、着色したいファイルを開きます。




2.次に「レイヤ」→「参照レイヤに設定」で線画レイヤを参照レイヤに設定したあと
　「レイヤ」→「新規ラスタレイヤ」で下塗り用のレイヤを作成します。




3.あとは（2）で作成した新規レイヤをレイヤパレットから線画レイヤより下位に移動させ、
　この新規レイヤに対して「塗りつぶし（主線を参照）」や「塗りつぶし（主線の中心まで）」など
　主線を参照して塗りつぶしの行えるツールで塗りつぶしを行えば完了です。




また、こうした塗りつぶしツールを使用する方法のほかに
「閉領域フィル（主線を参照）」などを使用する方法もありますので
くろ蜜さまのやりやすい方法で着色を行ってみてください。

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以上、取り留めのないことをだらだらと述べてきましたが、
少しでも参考になりましたら幸いです。
それと乱文失礼いたしました。