マウスを使ってキャンバス上を操作した場合も、同様にカーソルが
点滅する状態でしょうか。
その場合、一度こちらのページからIllustStudioMiniを最新版に
アップデートしてから、再度動作をお試しください。
もしペンタブレット使用時のみに点滅が起きるという場合は、
ペンタブレットドライバをアンインストールし、最新版のドライバを
再インストールしてみてください。
ワコムのペンタブレットの場合は、こちらのページから最新版の
ドライバをインストール出来ます。
依然現象が再現してしまう場合、下記についてお知らせください。
・ペンタブレットのメーカーと型番
・ペンタブレットドライバのバージョン
お手数ですが、よろしくお願いいたします。