まずはIllustStudio形式のレイヤーの保持をしておくために、
レイヤーパレットのレイヤーを[素材]パレットに登録し、
一旦データを退避させておいてください。
※最悪保存出来ずにソフトを閉じなければならなくなった場合も、
素材パレットに登録したデータは次回起動時に残ります。
登録したいレイヤーを選択し、[編集]メニュー→[素材の登録]→
[選択中のレイヤーを素材に登録]を選択して登録しておけば、
後で別のキャンバスに対してその画像を貼り付ける事が出来ます。
上記で画像のバックアップを取っていただいたら、下記の方法で保存が
出来るかどうかご確認いただけますでしょうか。
1.同じサイズの新規キャンバスを作成します。
2.元の作品の全レイヤーを選択し、[選択]メニュー→[すべてを選択]で
キャンバス全体を選択します。
3.[編集]メニュー→[コピー]でコピーし、新しく作ったキャンバスの方を
選択して[編集]メニュー→[貼り付け]で貼り付けます。
4.新しく作った方を保存出来るかどうかご確認ください。
お手数ですが、よろしくお願いいたします。