こんにちは
素材パレットで必要のない素材を選び下にあるゴミ箱アイコンをクリックすれば削除できます。
OSが不明ですがWindowsなら[Ctrl]を押しながらマウスで素材パレットの素材をクリックすると複数選択の状態になりますのでそのままゴミ箱アイコンをクリックすれば削除できます。
なお、ブラシ先端素材の場合はブラシサブツールでブラシを新規作成していると「***は以下のサブツール・ブラシプリセットで形状で使用されています・削除しますか?***(ブラシ名)」というダイアログが出ます。ブラシが必要ならいいえ、ブラシが要らないならはいをクリックします。