「選択範囲を塗りつぶし」メニューから閉領域が正しく塗りつぶされない

■環境
OS: Windows7
ComicStudioEx: 4.6.0

■再現方法
1. 枠線定規レイヤーからレイヤー変換でコマフォルダを１つ生成
    ・プレビューの解像度と表現色を指定する： ON (600dpi, 黒白(2bit))
    ・0.00 mmの余白を追加
    ・コマ枠画像をレイヤー化する：OFF
    ・コマ枠画像をラスタライズする：OFF
    ・変換後元のレイヤーを残す：ON
2. ラスターレイヤーを２つ新規生成 (600dpi, 黒白(2bit), 仕上げ)
3. 片方のラスターレイヤーにだけ、ペン(黒)で適当に(隙間が無いように)円を描く
4. コマフォルダの中に上記で生成したラスターレイヤーを２つとも移動する
5. 円を描いたラスターレイヤーを選択する
    ※ここでさらに「参照レイヤーに設定」をONしても以降の結果は変わらない
6. メニュー → 選択 → すべてを選択、で全域を選択状態にする
7. メニュー → 編集 → 選択範囲を塗りつぶし、で設定画面を開く
8. 設定画面で以下のように設定してOKボタンを押す
    ・描画色：黒
    ・透明部分に描画：ON
    ・閉領域を塗る：ON
    ・複数レイヤーを参照：ON
    ・フォルダ内のレイヤー：ON
    ・下描きを参照しない：ON
    ・文字を参照しない：OFF
    ・ベクターの中心線まで塗る：ON
    ・コマの外枠を参照：OFF
    ・閉じる隙間：0.00 mm
    ・拡張：0.00 mm

■結果
円の閉領域が黒で塗潰されず、コマ領域の全域が塗潰される

■パターン検証A
円を描いていない方のラスターレイヤーをコマフォルダ外に移動した後、
コマフォルダ内のラスターレイヤーをクリアして再び円を描き、
再現方法5.から流すと、円の閉領域は黒で塗潰される。

■パターン検証B
全てのレイヤーをコマフォルダ外に移動した後、
ラスターレイヤーをクリアして再び円を描き、
再現方法5.から流すと、円の閉領域は黒で塗潰される。

■質問とお願い
・コマフォルダの中と外で結果が違うのは仕様でしょうか？
  アクションに登録して使いたいので困るのですが・・・。
・当該メニュー操作で閉領域を塗る場合に動作が保障されないのは
  どのフォルダの中でしょうか？(テキストフォルダの中も？)
・不具合だった場合、4.6.2では直っていますか？(ReleaseNoteでは未確認)
・こちらで出来る代案の対処方法等があれば教えてほしいです

以上、宜しくお願い致します。