ご不便をおかけし、申し訳ございません。
今回はトンボレイヤーのみが無くなってしまった状態でしょうか。
その場合、下記の方法をお試しください。
1.トンボが消えてしまったページを開き、レイヤーパレットで
すべてのレイヤーを選択します。
2.[レイヤー]メニュー→[レイヤーのフォルダ化]を選択して、
全レイヤーを一つのレイヤーフォルダにまとめます。
3.レイヤーフォルダを選択した状態で、[ファイル]メニュー→
[素材の登録]→[レイヤー]を選択し、素材パレットに登録します。
4.新規作成でトンボの設定を同じにした原稿を作成し、
[3]で登録したレイヤーを貼り付けます。
[素材の貼り付け]ボタンをクリックすると位置がずれずに貼られます。
5.貼り付けられたレイヤーフォルダを選択し、[レイヤー]メニュー→
[フォルダ化の解除]で元のレイヤー構成に戻します。
お手数ですが、ご確認のほどよろしくお願いいたします。