ご質問いただいた件について、それぞれ回答いたします。
> 書き出し設定はグレースケールか
表現色はグレースケールで大丈夫す。
トーンが混ざっている原稿ですので、グレーにした上で、
[色の詳細設定]で[レイヤーに付与されたトーン効果を有効にする]に
チェックを入れてください。
こうすることで、トーン化したレイヤーはトーン、グレー部分はグレーで
出力されます。
> レイヤー自体は「乗算」→トーン化、をしたほうがいいのでしょうか？
基本的には合成モードは変えずに、[通常]のままトーン化して
いただければと思います。
> トーンはレイヤー編集→二値化したほうがいいのでしょうか？
トーン化することで2値の状態になるため、レイヤー自体を改めて
2値に変換する必要はございません。
逆にモノクロ2値のレイヤーに変換してしまうと、網点の状態が
確定されてしまい、トーン設定を後から変えるなどが出来なくなるので、
表現色はグレーのままにしておく方が望ましいです。
> 混じっていない場合の原稿でもカラーモードグレースケールで
書き出ししても大丈夫でしょうか
グレー部分の無い、完全にモノクロの原稿の場合は、モノクロ2階調で
出力いただく方が良いかと存じます。
よろしくお願いいたします。