お客様には、ご不便をおかけし申し訳ございません。
各種ツールやカラーパレットの情報は、ドキュメントフォルダ内の
[CELSYS]フォルダにて保持しております。
そちらに更新された情報が正常に保存できていない可能性がありますので、
以下の点をお知らせください。
・お使いのCLIP STUDIO PAINT DEBUTのバージョン
([ヘルプ]メニュー→[バージョン情報]から確認出来ます。)
・セキュリティーソフトをご使用の場合は、製品名とバージョン：
・Gペンなどのブラシサイズを変更後に、CLIP STUDIO PAINTの再起動を行い、
変更されたブラシサイズが保持されているか：
・[ファイル]メニューの[環境設定]を開き、どの設定でも構いませんので、
変更後、CLIP STUDIO PAINTの再起動を行い、変更された設定が保持されているか：
・CLIP STUDIO PAINTをどの方法で終了しても、登録したブラシが保持されないか
(例：右上の[×]アイコン、[ファイル]メニューの[CLIP STUDIO PAINTを終了])
お手数をおかけしますが、よろしくお願いいたします。