素材を登録した場合、画像を作成したキャンバスの解像度にかかわらず、
画像のピクセル数(ドット数)が維持されて登録されます。
それを貼り付ける際、ご記載いただいたように、貼り付け先の
キャンバスの解像度に最適化された状態(ピクセル合わせ)に
なりますので、解像度によっては素材のサイズ感が変わります。
例えばA4 350dpiのキャンバスはピクセル換算すると
2894×4093pxなので、1000px×1000pxのサイズで作った素材を
貼り付けた場合、キャンバス全体の12分の1程度の領域で
貼られます。
一方A4 600dpiのキャンバスはピクセル換算すると4093×7016pxなので、
同じ素材を貼った場合、キャンバス全体の35分の1程度の領域で貼られるため、
350dpiの方と比べると、より原稿に対して小さく表示されます。
※解像度が何dpiでも、1000×1000pxの画像はあくまでそのピクセル数となります。
上記を参考に素材の登録をお試しください。