「元画像を残すというのにチェックは入っていませんでした」と
ご記載いただいておりますが、念のため以下についてご確認いただけますでしょうか。
・選択範囲をとり、[編集]メニューから[変形]>[拡大・縮小・回転]を選択し
リサイズハンドルを出した状態で[ツールプロパティ]パレットを確認していただき、
[元画像を残す]にチェックが入っていないかご確認ください。
また、上記を行ってもご希望の動作とならない場合、
以下についてお知らせください。
・CLIP STUDIO PAINTのバージョンをお知らせください。
※Windowsは、[ヘルプ]メニュー → [バージョン情報]で確認できます。
・選択範囲を作成して[拡大・縮小・回転]のリサイズハンドルを表示させた状態で
大きさを変える前と変えた後の[ツールプロパティ]パレット全体の
スクリーンショットを撮影し、こちらに掲載していただけますでしょうか。
■スクリーンショットの取得手順
１．キーボードの[PrintScreen]または[Prt Sc]とキートップに表示されて
いるキーを押します。
２．[Windows スタート]メニューをクリックし、[すべてのアプリ]の
[Windows アクセサリ]から[ペイント]を選択します。
３．[ペイント]というアプリケーションが起動します。
４．画面左上の[貼り付け]アイコンをクリックします。
５．[PrintScreen]キーを押したときの画面のイメージが貼り付けられます。
６．[ファイル]メニューから[上書き保存]を選択し、デスクトップなど適当な
場所にファイルを保存します。
ファイルの種類はJPEGなどを選択してください。