メッシュの削除をする場合、[メッシュ移動]ツールなどで
画面上のメッシュをクリックして選択状態にしてから
Deleteキーを押してください。
図形のサイズ調整や移動は、同じようにメッシュを選択状態にして
移動したり、[メッシュ情報]パレットで調整を行えます。
また、[変形]→[形状変形]ツールで面を選択して引き延ばしたり
することも可能です。
画面をグレーに、というのは、CLIP STUDIO PAINTのように
インターフェースをグレーにしたいという事でよろしいでしょうか。
恐れ入りますが、CLIP STUDIO MODELERではインターフェースカラーの
切り替えが出来ないため、ご要望として検討をさせていただきます。