animatorさんの各ツール設定が判らないので確定的には言えませんが
→[透明箇所の操作]のオプション項目→「別のレイヤーへの選択切り替え」がONの場合
他のレイヤーにある画像や画像素材レイヤーなどをクリックしたときに
「他のレイヤーが選択」されてしてしまい、ベクターレイヤーの選択が解除されます。
ベクター線は複数のレイヤーにまたがって選択できないためです。
[オブジェクト]ツールオプション→[選択の追加]が「部分解除」に設定されている
場合は、「既に選択されたオブジェクトをクリックして解除」する操作のみを行うモードになっているので
他のレイヤーにある画像や画像素材レイヤーなどをクリックしても反応していないだけ、ということかなと。
★対策
[オブジェクト]ツールの[ツールプロパティ]で
[透明化ション操作]のオプション項目→「別のレイヤーへの選択切り替え」をOFFに設定して
同じようにベクター線を複数選択してみてください。これで不用意に選択状態が解除されることが
なくなりませんか?