さかもっちゃんさまこんばんは。朧月夜に舞う胡蝶と申します。
横から失礼します。
レイヤを残したまま描かれたものだけをリセットされたいとのことですが、
これはコマンドバーに存在する「消去」を使用することでレイヤに描かれた内容を消去することが可能です。
（レイヤに描かれた絵などを消去するだけで、「消去」実行後もレイヤ自体はそのまま残り続けます）
この「消去」は選択されたレイヤの情報 （絵など） のみを消去するものですが、
あらかじめレイヤパレットから必要なレイヤを選択しておくことで
複数のレイヤに描かれた内容をまとめて消去することが可能です。
（下記の例では一例としてすべてのレイヤの内容を消去しています。
また、3枚目の画像がピンクの格子模様になっていますが、
これは透明部分を表し本来は灰色の格子模様となるはずです。
（わたし自身がイラスタ使いのため、どうしてもイラスタと同じピンクの格子模様でないと落ち着かないことと
灰色の濃淡では何かと不便なため色を変えてあります））
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それともし、コマンドバーに「消去」が存在しない場合は
「ファイル」→「コマンドバー設定」の「編集」から「消去」を追加することが可能です。
以上、レイヤ内容の消去方法について取り留めもなくだらだらと述べてきましたが、
少しでも参考になりましたら幸いです。
それと乱文失礼いたしました。