mavsikaさまこんにちは。朧月夜に舞う胡蝶と申します。
横から失礼します。
レイヤを複数選択して同時に描画できる機能とのことですが、
塗りつぶしであれば複数の線画レイヤを参照しての塗りつぶしが可能ですよ。
（ただ、mavsikaさまが希望されている機能がどういうものなのか
よく分かりませんので、違うかもしれませんが・・・）
一応、複数のレイヤを参照元にしての塗りつぶしについて説明させていただきますね。
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1.まずレイヤフォルダを作成し、
参照元にしたい線画レイヤをすべてこのフォルダに収納します。
2.次に（1）で作成したフォルダを選択してから
「レイヤ」→「レイヤ設定」→「参照レイヤに設定」を選択します。
3. 塗りつぶしツールの「他レイヤを参照」（別に他のものでもかまいませんが（笑））を選択し、
ツールプロパティ、あるいは「サブツール詳細」ダイアログから
参照先を「参照レイヤ」に変更します。
（もし「複数参照」チェックボックスにチェックが入っていない場合は
忘れずにチェックを入れてください）
4.あとはレイヤパレットから色を塗りたいレイヤを選択して
任意の色で塗りつぶしを行うだけです。
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ただ、この方法は複数のレイヤを参照しての塗りつぶしは可能ですが
逆に1枚のレイヤを参照して複数のレイヤを同時に塗りつぶすといったことはできませんので
必要な場合は塗りつぶしたレイヤをコピペするなどして対応してください。
以上、取り留めのないことをだらだらと述べてきましたが、
少しでも参考になりましたら幸いです。
それと乱文失礼いたしました。