ご不便をおかけし、申し訳ございません。
CLIP STUDIO PAINTのバージョンを両方とも1.0.3と記載いただいていますが、
EXが使用できるのは1.2.0からとなっております。
お手数ですが、[ヘルプ]メニュー→[バージョン情報]からバージョンを
ご確認いただけると幸いです。
CLIP STUDIO PAINTは最新版1.2.3において、lipファイルのサムネイル表示に
対応しており、1.2.0以前に比べると保存時に時間がかかる場合がありますので、
EXに変更時にアップデートもされていた場合は、ご申告の状態になる
可能性があります。
保存速度に関しましては、今後の開発にて向上に努めてまいります。