CLIP STUDIO PAINTは、ツールごとに定規にスナップするかどうかの
設定が可能なため、ペンのみスナップ出来ない場合は、
ツールのスナップがOFFになっている可能性があります。
下記の手順で定規にスナップできるようになるかご確認ください。
1.スナップが効かないペンを選択します。
2.ツールプロパティの右下にある工具のアイコンをクリックして
[サブツール詳細]を開きます。
3.左側のメニューから[補正]を選択して、[スナップ可能]のチェックを入れます。
なお、この掲示板はCLIP STUDIOの掲示板のため、
CLIP STUDIO PAINTの掲示板に移動してもよろしいでしょうか。
お手数ですが、ご確認をお願いいたします。