印刷時の内部的な変換の仕様詳細についてはご案内が出来ませんが、
グレースケールの線の場合は、アンチエイリアスがかかっている分、
線の濃度によっては薄く出力される場合があるかと存じます。
最終的にモノクロ原稿にするのであれば、すでにお試しいただいているように
表現色をモノクロにして閾値を調整いただく方法が一般的です。
線のアンチエイリアスが有効なままで出力したい場合は、
線のレイヤーを複製すれば、重なった部分が濃くなりますので、
全体のニュアンスを崩さずに太い印象にすることも可能なので、
よろしければお試しください。