CLIP STUDIO PAINTではファイルの保存先を決定した後に、
書き出し設定のダイアログが出るため、そちらでモノクロ2階調を
ご選択いただけますでしょうか。
なお、レイヤー情報を維持した、画像を統合しないPSDファイルでの
出力時には、選択肢にモノクロ2階調はございません。
今回は原稿自体をモノクロで制作いただいているようですので、
グレースケールを選択して出力いただければと思います。
※ComicStudioでレイヤーを維持してモノクロ2階調でPSD出力した場合も、
PSD形式の仕様上、CLIP STUDIO PAINTと同様に、カラーモードとしては
[グレースケール]のデータとして出力されます。
ただし、もし制作した原稿内に、グレーで描画した箇所があるという場合は、
お手数ですが2値化の処理をしてからPSD書き出しをお試しください。