コメントありがとうございます。
すみません、こちらの勘違い(手違い)で下の２つあるレイヤーをフォルダに入れるのを忘れていました。
けも様のおっしゃる通りで、クリッピング指定している□線にのみ上のレイヤフォルダ(効果も含めて)が反映されるのは当たり前で、お恥ずかしい限りです。
実際は下の□レイヤー２つをフォルダにまとめて入れた状態ですと上の○フォルダを「通過」にしてもレイヤー効果が反映されない、が正しい状態でした。こちらはSAIですと思った通りに反映されていました。
また別に改めて要望を出そうと思います。
お手数をおかけして申し訳ありません、ご指摘の方ありがとうございました。
「通常」のフォルダでは処理はフォルダの中だけで閉じられてしまうので下のレイヤーには届きません
フォルダの下のレイヤーに効果をあたえるならフォルダを「通過」に設定します
クリッピングすると四角のトレス線にのみクリッピングされるのもおかしくはありません
丸の塗りのレイヤーの「加算」はフォルダーに入れる事で下のレイヤーには届かなくなります
フォルダーの中だけで完結する仕組みです
フォルダーを「下のレイヤーをクリッピング」せずに「通過」だけでよいかと思います
バグではないです
一つずつの処理を考えると何もおかしくはないと思います
間違ってたらごめんなさい