ご返答ありがとうございます。
ドキュメントフォルダを確認しました所、作成日が今日の日付となっておりました。
Windowsアップデートする直前まではCLIP STUDIO PAINTは正常に使えていた為
Windowsアップデートがなんらかの影響を与えたのかもしれませんね。
追記となるのですが、CLIP STUDIO PAINTが初期化された為
クラウドに取っていたバックアップからリカバリーをしたのですが
一部素材が復元されず、素材フォルダもおかしくなっていました。
リカバリーの注意事項にある「PAINTでブラシの先端が初期状態（黒丸）になる」
という状態にはならず、「素材を探す」からダウンロードした全てのブラシ先端の画像は反映されており、
下の一枚目の画像通り「すべての素材」の中にはあるのですが、
二枚目の画像のように「ダウンロード素材」は空っぽになっておりました。
【画像1】
【画像2】
そして、ブラシ素材ではない、画像素材（シームレス画像素材など）でダウンロードしていたものが
全て復元されませんでした。
下の画像のように、CLIP STUDIO 内の「ダウンロード履歴」には残っていますが、
「ダウンロード素材」にも「すべての素材」にも入っておりませんでした。
そして何故か、元々CLIP STUDIO PAINTに入っていた素材の要らないものを
全て削除していたのに、それらは全て戻ってきています。
これらの不具合が起きる前、別のPCにてバックアップデータからリカバリーした際には
このようなことにはなりませんでした。
別のPCでも今日、再度リカバリーをしましたが、
結果は今起きている不具合（素材が一部復元されない・フォルダがおかしい）
となりました。
何度も申し訳ありませんが、よろしくお願いいたします。
を削除する機能などはございません。
ドキュメントフォルダにあるCELSYSフォルダのプロパティを開いて
いただき、作成日をご確認ください。
WindowsUpdate以降の日付になっている場合ですと、WindowsUpdate
以降にCLIP STUDIO PAINTを起動した際にドキュメントフォルダ内に
CELSYSフォルダがなかったため、新規に作成されたと考えられます。
WindowsUpdateによるものなのか等は不明ですが、何らかの影響により
ドキュメントフォルダ内に処理が加わったということかと存じます。