スレ主さんが「ミス」と判断している状況がどちらの結果を指しているのか、伝わって来ないので単に「統一して」と要望しても反対の出るところでしょう。
スレ主さんの利用しているアニメーションセルフォルダーと、その中のレイヤーフォルダーの構造が判らないので一概には言えませんが
オートアクションで新規レイヤーを作成する技量をお持ちなら、代案はあります。
選択しているレイヤーフォルダーが開いている・閉じているに関わらず、レイヤーフォルダーの上（前面）に新規レイヤーを作成するオートアクション（1）
スレ主さん作成のオートアクションで「新規ラスター（ベクター）レイヤー」実行【後】に次のコマンドを追加します。
「前面へ」
選択しているレイヤーフォルダーが開いている・閉じているに関わらず、レイヤーフォルダー内に新規レイヤーを作成するオートアクション（2）
（条件としてレイヤーフォルダー内に「下絵」とかの特定の名称を持ったレイヤーが存在している事）
スレ主さん作成のオートアクションで「新規ラスター（ベクター）レイヤー」実行【前】に次のコマンドを追加します。
「編集レイヤーの変更／レイヤー名：下絵」
注１：オートアクション（2）はレイヤーフォルダーが閉じている場合、結果的に開きますが、
現行バージョンには「閉じる」のコマンドが無い為、閉じたい場合は手動で閉じます。
注２：オートアクション（2）で「編集レイヤーの変更」はフォルダー内の何処にあっても探し出しますが、その前面に作成されるので、
上下関係を調整したい場合は必要に応じて複数の「前面へ」「背面へ」のコマンドをオートアクションに組み込んで調整もできます。
注３：オートアクション（2）で必要なレイヤー名「下絵」は「ダミー」や「0」等、何でも構いません。
お試しあれ。