最新版にアップデートすると初期化されてしまった。

ご確認頂き、ありがとうございます。

アップデートした後の初めての起動で問題が起きたのではなく、
その日の内は使えていたという事でしたらアップデート自体は関係が
ないかと思われます。

以下の点についてお知らせください。

・OneDriveを使用されていますでしょうか。
　また、[ドキュメント]をOneDrive配下に設定する事ができますが、
　そちらを設定されていましたでしょうか。

・ワークスペースのレイアウトが全く違うものになっているとの事
　でございますが、ワークスペースの登録は行われていましたでしょうか。

・クラウド設定をされ、ソフトウェアバックアップはされていましたで
　しょうか。

・アップデート前に使用されていたCLIP STUDIO PAINTのバージョンを
　お知らせください。

・[ドキュメント]フォルダにございます[CELSYS]フォルダを右クリックし、
　表示されるメニューにて[プロパティ]を選択した際に表示される画面の
　[作成日時]に表示されている内容をお知らせください。

　また、[CELSYS]フォルダを開き、中身が表示されましたら、その
　状態のウィンドウのスクリーンショットを取得し掲載ください。

・OS側の設定で[ドキュメント]フォルダを移動されたという事はございます
　でしょうか。

・[ファイル]メニュー→[環境設定]を選択し、表示される画面左側で
　[インターフェース]を選択し、画面右側にて[タッチ操作に適した
　インターフェースに調整する]のチェックは外れている状態でしょうか。
　チェックが入っている状態でしょうか。

・ご使用のパソコンのメーカー名、型番をおしらせください。

・セキュリティソフトを使用されていますでしょうか。
　また、使用されている場合は、ソフト名とバージョンも合わせてお知らせ
　下さい。

よろしく願いいたします。