お問い合わせありがとうございます。
CLIP STUDIOのクラウド機能は、本来クラウドのデータを直接消すことが
出来ません。
CLIP STUDIOの[作品一覧]からPC上のファイルを削除すると、
初めてクラウド上のファイルも削除されるようになっております。
恐れ入りますが、詳細の状況をこちらで把握するために、以下について
ご確認いただけますでしょうか。
・今回クラウドのファイルをどのような方法で消したか、詳細の手順をお知らせください。
・USBフラッシュメモリから消えてしまったファイルは、今回クラウドから消したという
ファイルと同一のものでしょうか。
それとも、全く無関係のファイルでしょうか。
・CLIP STUDIOのバージョンをお知らせください。
※CLIP STUDIOの右上の[?]アイコンの[バージョン情報]から確認できます。
・Windowsの[ごみ箱]内に、消えてしまったファイルは残っていないでしょうか。
お手数ですが、よろしくお願いいたします。